DSS和MIS是两种重要的信息系统，被广泛用于各种企事业单位的信息管理和决策支持活动，两者部分功能交叉。
（1）DSS追求的目标是高效能，即想办法把事情办得尽可能好一些，以提高决策的能力和效果；而MIS追求的目标是高效益，即设法把事情办得快一些，以提高管理水平。
（2）DSS着眼于决策，即着重考虑如何根据决策问题的需要，为决策者提供有价值的信息，这些信息通常由源数据经过加工、提炼、浓缩而得到；MIS着眼于信息，即着重考虑如何完成例行业务活动中的信息处理任务。
（3）DSS的设计思想是实现一个具有巨大发展潜力的、适应性强的开放系统；而MIS的设计思想是实现一个相对稳定而协调的工作系统。
（4）DSS的设计原则是强调充分发挥人的经验、智慧、创造力，努力使系统设计有利于个人或组织决策行为的改善。因此，通常情况下，DSS用户直接参与开发；而MIS的设计原则是强调系统的客观性，努力使系统设计符合组织的实际情况。
（5）DSS的设计方法是以模型驱动的，重视决策模式的研究与模型、知识的使用，并且侧重采用以用户参加为主的、非线性的、自适应设计方法；而MIS的设计方法是以数据驱动的，以数据库设计为中心，并且强调采用线性的、结构化设计方法。
（6）DSS通常由用户接口系统、数据库系统、模型库系统和知识库系统组成；而MIS通常由用户接口系统和数据库系统组成。
（7）DSS能够帮助解决的是半结构化和非结构化的决策问题，并且以人机对话作为系统工作的主要方式；而MIS只能解决结构化的决策问题，并且人工干预日趋减少。这一点是DSS与MIS的主要区别。
