选项A正确，DataWorks支持跨工作空间发布，意味着项目空间prj1的调度任务、资源文件以及自定义函数等可以通过发布流程迁移到项目空间prj2，这符合跨工作空间发布的应用场景描述。
选项B错误，虽然在配置发布环境时，目标工作空间通常是当前账号已加入的（即用户已经是目标工作空间的成员），但这并不严格限定于“同一个组织”。特别是提到跨云发布时，可以跨账号、跨地域或跨云平台进行节点克隆迁移，表明项目空间之间不一定需要隶属于同一组织。
选项C正确，数据本身并不通过发布流程迁移。发布流程主要涉及任务、资源、依赖关系和配置等元数据的迁移，而不是实际存储在表中的数据迁移。
选项D正确，表结构变更作为任务的一部分，可以通过发布流程部署到目标项目空间，即项目空间prj2，这符合发布环境中对任务及依赖关系处理的描述。
