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如果行为人故意毁坏正在使用中的交通工具、交通设施，足以使交通工具发生倾覆、毁坏危险，因而危害交通运输安全的，应当以破坏交通工具罪、破坏交通设施罪论处。如果行为人故意毁坏不影响安全行驶的辅助性设备，因没有危害公共安全，不构成破坏交通工具罪、破坏交通设施罪，但情节严重的，构成故意毁坏财物罪。本题中，甲砸碎正在行驶中的公共汽车车窗，并未危害公共安全，但造成经济损失1万余元，情节严重，构成故意毁坏财物罪。