自考毕业档案有3种处理方式：1、把档案交给就职单位“人事部门”管理；2、把档案存放在“单位委托的人力资源公共服务”机构；3、到户籍所在地“人力资源”公共服务机构，申办个人委托存档。
需要先到户口所在地人才市场开档案接收函，然后找到学生档案所在档案室将学生档案转到户口所在地人才市场，在人才市场办理入档手续，同时办理学生档案转人事档案的程序，最后将自考毕业证复印件和自考毕业生登记表原件放进人事档案。
大专自考毕业档案补办方法：明确愿意接收新补办好的学籍档案的档案管理单位；在补办档案之前向负责保管档案的单位申请开具调档函；联系自考大专毕业院校，了解清楚该校毕业生补办档案的具体要求及相关内容；准备补办档案所需材料；等待审查；办理档案存档手续。
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